干扰素的作用机理是通过调节免疫功能帮助机体清除病毒，机体清除病毒的过程，也就是机体免疫系统攻击感染肝细胞的过程，因而象急性肝炎发作—样，会伴有肝脏的炎症反应，因此用干扰素治疗5—8周，约50%的病例ALT迅速增高，这反映免疫系统被激活，而开始清除感染的肝细胞。一般在治疗后3～4个月ALT即恢复正常并伴有HBeAg和HBV DNA的转阴。ALT升高，是机体对干扰素有应答的标志，通常预后较好。